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安諾優達戰略性引入Revio平臺,為三代科研服務保駕護航!
2023-03-13 16:27

2022年10月25日,Pacific Biosciences(PacBio)宣布推出新一代高精度長讀長測序系統Revio。為強化三代測序服務中心建設,提升服務效能,安諾優達戰略性引進Revio測序平臺,將成為國內首批提供Revio三代測序科研服務的供應商。


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圖1 Revio儀器照片(來源:PacBio官方網站)



Revio介紹

高密度25M芯片,并行4個Cell更快更靈活


全新的SMRT cell芯片,搭載高達2500萬個ZMW(零模波導孔),是上一代Sequel II 系列8M 芯片的3倍!Revio系統同時并行4個SMRT Cell,每天提供360 Gb的HiFi序列,在HiFi數據通量增加15倍的前提下,運行時長縮短了6個小時,相當于每年可以完成1300個人類全基因組。


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圖2 Revio和Sequel Ⅱe對比(來源:PacBio官方網站)


高保真序列,準確識別變異


Revio系統基于CCS測序模式,使用Google Health DeepConsensus高級深度學習算法,高準確度的HiFi數據產出,能夠實現堿基Q30≥90%,序列準確率中值≥Q30。Revio相對于Sequel Ⅱe系統,在檢測SNV、Indels和SVs等變異上的表現較為一致,甚至實現部分超越。


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圖3 Revio和Sequel Ⅱe準確率對比(來源:PacBio官方網站)


先進的計算系統,算力提高20倍


Revio采用先進的NVIDIA GPU系統,與Sequel Ⅱe相比,Revio的計算能力提高20倍。該系統不僅可以加速Basecalling來滿足Revio的高通量,而且搭載的AI計算集成深度學習算法也可用于DNA甲基化的高效檢測。此外,優化后的BAM文件格式可以使每個堿基的儲存空間減少5%。


安諾優達基于Pacbio Revio測序平臺高通量、高準確性、高覆蓋率的特征,結合自身多年的技術積累和產品經驗,正式為生命科學多個領域,如人類遺傳學、癌癥研究、農業基因組學等研究領域提供以下服務內容:


01 動植物泛基因組測序

Revio測序平臺多樣本混合,高通量快速測序為泛基因組研究帶來新突破。安諾優達泛基因組測序和聯合分析產品,助力您獲得豐富的物種遺傳變異信息,解析物種性狀差異的基因密碼,揭示物種進化起源。


02 動植物T2T基因組組裝

低測序成本,高測序通量,高測序質量的Pacbio Revio數據,為T2T基因組的組裝提供優質的解決方案。安諾優達基因組T2T組裝為染色體起源、染色體重組、進化等領域研究掃平障礙。


03 動植物單倍型基因組研究

Revio平臺能快速產生高質量HiFi數據,服務于復雜基因組的準確解析,為單體型基因組和進化研究爭分奪秒,搶占先機。安諾優達單倍型基因組產品持續應用于解析等位基因的表達差異,挖掘群體遺傳規律,保存優質種質資源等多領域。


04 全基因組測序、重測序

Revio平臺一年可以提供1300個30X覆蓋度的人類基因組測序數據,如此高數據量的產出,對于人類全基因組測序,人類、動植物重測序具有深遠的意義。安諾優達全基因組測序和重測序產品為人類遺傳學、癌癥等疾病研究、動植物進化研究等多領域保駕護航。



安諾優達已配備Pacbio Sequel I, Pacbio Sequel II, Pacbio Sequel IIe等共計21臺Pacbio三代測序儀器,并引入了Megaruptor3、Femto Pulse Systems、BluePippin、ELF Sage等硬件設備,可實現HiFi穩定高產出,具備大規模的測序研發及服務能力。目前已與清華大學、中國農業大學、中科院遺傳與發育所、中國海洋大學、中國農業科學院、福建農林大學等多家科研院所在三代測序服務項目中開展了深度合作,助力文章發表于Cell、Nature、Science、Nature Biotechnology、Nature Plants、Molecular Plant、Nature Communications、Communications Biology等多個國際期刊。此次Revio平臺的引入,將進一步夯實安諾優達大規?;蚪M中心的硬件基礎,為基因測序業務的全球化拓展增添重要競爭力。


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